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1924年
学院最早的课程设置，可追溯至1924年广东中医药专门学校创建之时，当时设立有全体学、生理学、卫生学、国文、化学、病理学、诊断学等中西医基础课程
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1956年
1956年广州中医学院成立后，邓铁 涛、沈炎南等一批著名专家承担中医 基础课程的教学任务
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1984年
1984年，学校设立基础部，即为基础医学院前身
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1997年
1997年，基础部正式更名为基础医学院
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2003年
2003年，学校教代会联席会议通过二级教学机构重组方案，基础医学院负责全校医学学科门类的基础教学，保留13个教研室，同时开展相关专业的研究生教育和科学研究
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2018年
2018年，学院成立3个中心、11个系（实验室），撤销原教研室机构设置
